1. Termodynamikkens anden lov: Denne lov siger, at i enhver energitransformation går noget energi altid tabt som varme. Det betyder, at når en organisme indtager mad, går noget af energien i den mad tabt som varme under fordøjelsen og respirationen.
2. Ineffektiv energioverførsel: Ikke al den energi, som en organisme forbruger, bliver brugt til vækst og reproduktion. Noget energi bruges til vedligeholdelsesaktiviteter, såsom at holde kroppen varm og bevæge sig. Derudover går noget energi tabt gennem affaldsprodukter, såsom afføring og urin.
3. Konkurrence og prædation: I ethvert økosystem er der konkurrence om ressourcer, herunder fødevarer. Det betyder, at ikke alle organismer er i stand til at få den mad, de skal bruge for at overleve. Derudover bliver nogle organismer byttet ud af andre organismer, hvilket yderligere reducerer mængden af energi, der sendes videre til det næste trofiske niveau.
4. Miljøfaktorer: Miljøfaktorer, såsom temperatur, nedbør og sollys, kan også påvirke mængden af energi, der overføres mellem trofiske niveauer. For eksempel i kolde klimaer kan organismer være nødt til at bruge mere energi for at holde sig varme, hvilket efterlader mindre energi til vækst og reproduktion.
Som et resultat af disse faktorer bliver kun en lille procentdel af den energi, der er tilgængelig på et trofisk niveau, videregivet til det næste trofiske niveau. Det betyder, at mængden af energi, der er tilgængelig for organismer på højere trofiske niveauer, er begrænset, hvilket kan have en betydelig indvirkning på økosystemernes struktur og funktion.