Der er ingen enkelt gennemsnitlig dybde for marine biomer på grund af den store mangfoldighed af havmiljøer. Marine biomer kan variere fra lavvandede kystnære farvande, der strækker sig fra kystlinjen til blot et par hundrede meter i dybden, til de dybeste afgrundsletter, som kan nå dybder på over 6.000 meter. Dybdevariationerne i marine biomer skaber forskellige habitater og forhold, der understøtter en bred vifte af marine organismer tilpasset specifikke dybdeområder.