Den kemiske formel for kalksten er CaCO3. Når vand (H2O) opløser kuldioxid (CO2) fra atmosfæren, danner det kulsyre (H2CO3). Denne svage syre reagerer med kalksten, hvilket får den til at opløses og danne calciumbicarbonat (Ca(HCO3)2), som derefter føres væk af vand.