Hvilket protein er det?

Imaging massespektrometri (IMS) gør det muligt at se den rumlige fordeling af molekyler i et tyndt vævssnit baseret på deres molekylmasser. Det er et kraftfuldt værktøj til opdagelse af biomarkører, men det er stadig en vanskelig opgave at identificere proteiner opdaget af IMS.

Jeffrey Spraggins, Ph.d., og kolleger i Mass Spectrometry Research Center, rapporter nu om en forbedret teknologi til proteinidentifikation i IMS.

Efterforskerne automatiserede væskeekstraktionsoverflade analyse, hvilket indebærer at dosere små mængder opløsningsmiddel på vævsoverfladen for at ekstrahere proteiner og andre forbindelser, efter traditionel protein-identifikation (proteomisk) teknik.

I den 15. marts Hurtig kommunikation i massespektrometri , de rapporterer robotoverflademikroekstraktioner fra tynde vævssnit ved hjælp af en glaskapillæropsætning, koblet direkte til væskekromatografi/massespektrometri til proteomisk analyse. De fandt forbedret reproducerbarhed og dråbeopløsning med den robotiske ekstraktion.

Kobling af ekstraktionen direkte til analysen er mere egnet til geografiske proteomiske eksperimenter med høj gennemstrømning og vil hjælpe med udfordringen med at identificere proteiner observeret af IMS.