Brug af fragmentbaserede tilgange til at opdage nye antibiotika

I juli 2018-udgaven af SLAS Discovery , en oversigtsartikel opsummerer nye metoder til fragment-baseret blyopdagelse (FBLD) til at identificere nye forbindelser som potentielle antibiotika.

Forfatterne Bas Lamoree og Roderick E. Hubbard fra University of York (UK) forklarer, hvordan FBLD fungerer og illustrerer dets fordele i forhold til konventionel high-throughput screening (HTS). Specifikt, hvordan FBLD øger chancerne for at finde hitforbindelser; hvordan dens metoder kan levere hits uden den massive investering, der kræves for HTS; og hvordan ved at starte i det små, FBLD giver medicinske kemikere flere muligheder for at bygge flere lægemiddellignende forbindelser. Disse principper er illustreret i gennemgangen og understøttet af nyere eksempler på opdagelsesprojekter mod en række potentielle antibiotikamål.

Stigningen i antibiotikaresistens er nu anerkendt som en reel trussel mod menneskers sundhed. Imidlertid, der er ikke udviklet nye antibiotika i mange årtier. FBLD begynder med at identificere lavmolekylære forbindelser (fragmenter), som binder til proteinmål. Information om, hvordan fragmenterne binder til deres proteinmål, bruges derefter til at dyrke forbindelserne til potente lægemiddelkandidater. Fordi fragmenterne er små, de er mere tilbøjelige til at passe ind i et bindingssted, og hvert fragment repræsenterer et stort antal potentielle forbindelser.