Brug af massespektrometri til at isolere guaninrige DNA-ioner

Et team af forskere ved Université de Bordeaux har udviklet en måde at bruge massespektrometri til at isolere guaninrige DNA-ioner. I deres papir offentliggjort i tidsskriftet Videnskab , forskerne beskriver deres metode, og hvordan den kan bruges til at udvide mulighederne for massespektrometri til strukturel analyse. Perdita Barran med University of Manchester har udgivet et Perspective-stykke, der beskriver historien om studiet af molekylær chiralitet i krystaller i samme nummer, og giver også et overblik over holdets arbejde i Frankrig.

Forskerne bemærker, at cirkulær dikroismespektroskopi er det primære værktøj til at skelne mellem ikke-identiske spejlbillede-molekyler. Cirkulær dikroisme er, hvor et medium har egenskaben af ​​ulige absorption af venstre og højre plan-polariseret lys - hvilket resulterer i elliptisk polariseret emergent lys. Cirkulær dikroisme spektroskopiteknikker er baseret på at drage fordel af forskellene i absorption af højre versus venstre cirkulært polariseret lys. Men det kræver brug af opløsningsfaseprøver, hvilket gør det vanskeligt at fortolke resultaterne og også begrænser dets anvendelse til små molekyler. I denne nye indsats, forskerne har udviklet en ny måde at nå samme mål med lettere fortolkede resultater.

Arbejdet involverede at kombinere cirkulær dikroisme med massespektrometri. De brugte først massespektrometri til at isolere guaninrige DNA-sekvenser rige på ioner. De bestrålede derefter DNA'et med blaster fra en laser - som tvang DNA-ionerne til at miste en elektron, som ændrede deres ladetilstand. Derefter, ved at måle omfanget af responsen, de var i stand til at bestemme ionens chiralitet og lysets polarisering. Det gjorde det muligt for forskerne at opnå et massespektrum af ioner - så ved at skifte mellem de forskellige lyspolariseringer, de var i stand til at beregne cirkulær dikroisme. Forskerne foretog også en undersøgelse af DNA-komplekser med ammonium- og kaliummodioner, og som et resultat, fået et nyt perspektiv på individuel molekyleopløsning.

Ved at gennemgå deres arbejde, forskerne fandt ud af, at rekonstruerede cirkulære dikroisme-ionspektre lignede konventionelle modparter i opløsningsfasen. De foreslår, at deres teknik vil give forskere et andet værktøj til at udføre massespektrometri under strukturelle analyser.

© 2020 Science X Network