Forskere skræddersyr hurtig og effektiv N-phosphopeptides berigelsesstrategi

Protein N-phosphorylering spiller en kritisk rolle i central metabolisme og to/multikomponent signalering af prokaryoter. Desuden, den eksisterer som mellemprodukter for nogle vigtige enzymer hos pattedyr.

Imidlertid, de nuværende berigelsesmetoder for O-phosphopeptider foretrækkes ikke for N-phosphopeptider på grund af den iboende labilitet af P-N-binding under sure betingelser. Derfor, den effektive N-phosphoproteom-analyse er stadig udfordrende.

For nylig, en forskningsgruppe ledet af prof. Zhang Lihua og Pro. Zhang Yukui fra Dalian Institute of Chemical Physics (DICP) fra det kinesiske videnskabsakademi (CAS) foreslog en hurtig og effektiv berigelsesstrategi for N-phosphopeptider.

Deres undersøgelse blev offentliggjort i Naturkommunikation den 4. december.

Inspireret af naturligt forekommende fosfataser, som tilvejebringer specifikke Zn (II) -centrale enzymatiske lommer til binding af fosfatenheder af substrater, forskerne designede bis (zink (II) -dipicolylamin) molekylær (DpaZn) til fosfatmålgenkendelse under neutrale forhold.

Kæmper den hurtige masseoverførselsevne for sub-2 μm kerneskal-silica-mikrosfærer, DpaZn-funktionaliseret sub-2 μm kerne-skal silica mikrosfærer (SiO ₂ @DpaZn) blev designet til berigelse af N-phosphopeptider på spidsen under neutrale betingelser. I alt, 3, 384 N-pho-steder, indeholdende 611 pH -værdier, 1618 pLys og 1155 pArg, blev identificeret fra HeLa -cellelysater.

Den nye N-phosphorylerede proteom-analysemetode giver ikke kun grundlæggende data til dybdegående undersøgelse af dens biologiske funktion, men også teknisk støtte til fremme af udviklingen af ​​præcisionsmedicin, syntetisk biologi og andre områder.