Oversigt over HERV-K RT struktur. (A ) HERV-K RT med molA-underdomænerne farvet efter konvention og molB-underenheden farvet i gråt (Venstre ). Til højre , molA og molB er farvet af underdomæne. MolA:fingre (blå), håndflade (rød), tommelfinger (grøn), forbindelse (gul), RNase H (orange). MolB:fingre (periwinkle), håndflade (pink), tommelfinger (lysegrøn), forbindelse (sennep). (B ) Overlejring af HIV-1 (5TXL.PDB) (i gråt) på HERV-K RT molA med en RMSD på 2,67 Å for 381 Ca-atomer. HERV-K mol A:fingre (blå), håndflade (rød), tommelfinger (grøn), forbindelse (gul), RNase H (orange). α-helixerne af HERV-K er angivet, og den fulde sekundære strukturanalyse findes i SI-tillæg , Fig. S6. (C ) MolB:fingre (periwinkle), håndflade (pink), tommelfinger (lysegrøn), forbindelse (sennep). α-helixerne af HERV-K er angivet, og de fulde sekundære strukturtildelinger findes i SI-tillæg , Fig. S6. αF2 af molB-palmen er en unik helix i HERV-K. Den ækvivalente strækning i molA er en spiral, der ligner HIV-1 RT. Kredit:Proceedings of the National Academy of Sciences (2022). DOI:10.1073/pnas.2200260119
Krystalstrukturen af en human endogen revers transkriptase har ligheder med HIV-revers transkriptase, et velkendt traktable lægemiddelmål, som vil hjælpe med at designe lægemidler til behandling af kræft og andre sygdomme, ifølge en undersøgelse, der er medforfatter af en Rutgers-forsker.
Undersøgelsen, offentliggjort i Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS ), beskriver den første nogensinde højopløselige tredimensionelle struktur af en endogen revers transkriptase - specifikt human endogen retrovirus-K (HERV-K) revers transkriptase (RT). Tidligere forskning har fundet ud af, at en betydelig del af det menneskelige genom består af gentagne elementer, der er levn fra tidligere virusinfektioner, som er forbundet med en række alvorlige sygdomme, herunder kræft.
Ifølge undersøgelsen giver strukturen terapeutiske muligheder for RT-hæmmere – antiretrovirale lægemidler, der bruges til at behandle HIV-infektion eller AIDS, og også hepatitis B – ved cancer, autoimmune og neurodegenerative sygdomme.
"Denne undersøgelse markerer et væsentligt skridt fremad i vores forståelse af endogene retrovira, og hvordan de kan målrettes til at behandle sygdom," sagde Eddy Arnold, der er bosiddende fakultetsmedlem ved Rutgers Center for Advanced Biotechnology and Medicine (CABM) og medlem af videnskabeligt rådgivende bestyrelse. bioteknologivirksomheden ROME Therapeutics.
"Karakterisering af strukturen af HIV RT var et kritisk vendepunkt i udformningen af nye lægemidler til at bekæmpe den dødelige virus," sagde Arnold, en fremtrædende professor og bestyrelsesprofessor i kemi og kemisk biologi ved Rutgers. "Tilsvarende kan dybere indsigt i menneskelig endogen RT bane vejen mod en ny klasse af terapier for kræft og andre alvorlige sygdomme."
Gentagne elementer i genomet såsom HERV-K er ofte overudtrykt i cancer og fremkalder biologiske virale mimikreaktioner, der kan ændre tumormikromiljøet, ifølge tidligere forskning.
Undersøgelsen er medforfattet af forskere fra ROME Therapeutics, et bioteknologifirma, der har til formål at udvikle nye terapier til kræft og autoimmune sygdomme ved at forske i det mørke genom - store strækninger af ukendt genetisk materiale, der repræsenterer mere end 60 procent af det menneskelige genom - for lægemiddeludvikling.
"I denne publikation beskriver vi for første gang krystalstrukturen af en endogen revers transkriptase, en kendt som HERV-K RT, og viser, at den har bemærkelsesværdige ligheder med HIV revers transkriptase, et velkendt behandleligt lægemiddelmål," sagde Dennis Zaller, videnskabelig chef i ROM. "Denne præstation er en milepæl inden for Dark Genome-feltet og kaster lys over muligheder for strukturbaseret lægemiddeldesign baseret på etablerede antivirale mål, der er til stede i vores menneskelige genom. Dette arbejde er resultatet af et fantastisk samarbejde mellem ROMEs exceptionelle strukturbiologiske team og verdensledende krystallografer." + Udforsk yderligere