Jern-responsive regulatorer (Irr): Irr-proteiner er transkriptionelle regulatorer, der kontrollerer ekspressionen af gener, der er involveret i jernoptagelse og udnyttelse. Når jernniveauet er lavt, binder Irr-proteiner sig til specifikke DNA-sekvenser og aktiverer transskriptionen af disse gener.
Pels (jernoptagelsesregulator): Pels er en transkriptionel repressor, der kontrollerer ekspressionen af gener involveret i jernoptagelse og udnyttelse. Når jernniveauerne er høje, binder Fur til specifikke DNA-sekvenser og undertrykker transskriptionen af disse gener.
Siderophores: Sideroforer er små molekyler, der produceres af bakterier for at chelatere og transportere jern. Sideroforer udskilles i miljøet, hvor de binder sig til jern og danner komplekser, som kan optages af bakterierne.
Fe-S-klynger: Fe-S klynger er små jern-svovl cofaktorer, der er essentielle for aktiviteten af mange enzymer. Når jernniveauet er lavt, nedsættes syntesen af Fe-S-klynger, hvilket kan føre til hæmning af enzymer, der kræver disse cofaktorer.
Hem: Hæm er et jernholdigt porphyrin, der er essentielt for aktiviteten af mange enzymer, herunder cytochromer og peroxidaser. Når jernniveauet er lavt, nedsættes syntesen af hæm, hvilket kan føre til hæmning af enzymer, der kræver denne cofaktor.
ROS (reaktive oxygenarter): Jern kan også mærkes af bakterier gennem produktionen af reaktive oxygenarter (ROS). ROS produceres af Fenton-reaktionen, som opstår, når jern reagerer med hydrogenperoxid. ROS kan beskadige DNA, proteiner og lipider og kan føre til celledød. Bakterier kan bruge produktionen af ROS til at fornemme jernniveauer og regulere ekspressionen af gener involveret i jernoptagelse og udnyttelse.
Dette er blot nogle få af de mekanismer, som nitrogenfikserende bakterier bruger til at fornemme jern. Ved at registrere jernniveauer kan bakterier regulere ekspressionen af gener, der er involveret i jernoptagelse og udnyttelse, og sikre, at de har tilstrækkeligt med jern til at opfylde deres metaboliske behov.