Nitrogen, det centrale atom i ammoniak, har fem valenselektroner. Hvert brintatom har på den anden side én valenselektron. For at opnå en stabil elektronkonfiguration deler nitrogen sine tre valenselektroner med de tre hydrogenatomer gennem kovalente bindinger.
Hvert brintatom bidrager med sin enkeltvalenselektron til at danne en kovalent binding med nitrogen, hvilket resulterer i tre N-H kovalente bindinger. Disse bindinger holder atomerne sammen og bestemmer ammoniakens molekylære struktur.