Elektronerne til fotosystem II kommer fra spaltning af vandmolekyler. Denne proces udføres af det oxygen-udviklende kompleks (OEC) af fotosystem II. OEC er en klynge af fire manganioner og en calciumion, der holdes sammen af et proteinstillads. Når lysenergi absorberes af fotosystem II, exciterer den en elektron i klorofylmolekylet i reaktionscentret. Denne elektron overføres derefter til en elektronacceptor, og den når til sidst OEC. OEC bruger elektronens energi til at opdele et vandmolekyle i to protoner og et oxygenatom. Protonerne pumpes ind i thylakoidens lumen, mens iltatomet frigives til atmosfæren.