Et molekyle med delvist ladede områder kaldes et polært molekyle. Et polært molekyle er et molekyle, hvor elektronerne ikke er jævnt fordelt, hvilket resulterer i en adskillelse af positive og negative ladninger. Dette kan opstå, når molekylet har forskellige elektronegative atomer, hvilket betyder, at de har forskellige evner til at tiltrække elektroner. Det elektronegative atom tiltrækker elektroner stærkere, hvilket skaber en delvis negativ ladning på det atom og en delvis positiv ladning på det andet atom. Denne adskillelse af ladninger skaber en dipol, som er en vektor, der repræsenterer størrelsen og retningen af ladningsadskillelsen. Polære molekyler er vigtige i mange kemiske og biologiske processer, såsom hydrogenbinding og solvatisering.