1. Syre-base-katalyse: Dette involverer overførsel af protoner (H+) mellem enzymet og underlaget. Dette kan bruges til at aktivere underlaget eller stabilisere en mellemstat.
2. Kovalent katalyse: Dette involverer dannelse af en midlertidig kovalent binding mellem enzymet og underlaget. Dette kan hjælpe med at bringe underlaget ind i den korrekte orientering for reaktion eller stabilisere en overgangstilstand.
3. Metalionkatalyse: Nogle enzymer bruger metalioner som zink, magnesium eller jern for at lette katalyse. Disse ioner kan hjælpe med at stabilisere ladninger, binde underlag eller deltage i redoxreaktioner.
4. Nærhed og orienteringseffekter: Det aktive sted bringer de substrat- og katalytiske grupper sammen i den korrekte orientering og øger reaktionshastigheden.
5. Stamme eller forvrængning: Det aktive sted kan binde underlaget på en måde, der forvrænger dens konformation, hvilket gør det mere reaktivt.
Eksempler på specifikke reaktioner:
* Hydrolyse: Bryder et binding ved tilsætning af vand (f.eks. Peptidaser, lipaser).
* phosphorylering: Tilsætning af en phosphatgruppe (f.eks. Kinaser).
* Oxidationsreduktion: Overførsel af elektroner (f.eks. Oxidoreduktaser).
* isomerisering: Omarrangering af atomer inden for et molekyle (f.eks. Isomeraser).
* ligandbinding: Enzymer kan også binde til andre molekyler, såsom hormoner, for at regulere deres aktivitet.
Det er vigtigt at huske, at det aktive sted for et enzym er meget specifikt for dets underlag og den reaktion, det katalyserer.
Derfor vil den hyppigste kemiske reaktion på det aktive sted variere afhængigt af det specifikke enzym og dets funktion.