Videnskab
 Science >> Videnskab >  >> Kemi

Hvilke typer kemiske bindinger er involveret i at opretholde den sekundære struktur et protein?

Den sekundære struktur af et protein opretholdes primært af brintbindinger . Disse obligationer dannes mellem rygradatomer af polypeptidkæden, specifikt mellem hydrogenatomet i en amidgruppe (N-H) og iltatomet i en carbonylgruppe (C =O) .

Her er en sammenbrud:

* alfa-helix: Hydrogenbindingerne dannes mellem carbonyl -ilt af en aminosyrerest og amidhydrogenet i aminosyreresten fire positioner ned i kæden. Dette skaber en spiralformet struktur.

* beta-ark: Hydrogenbindingerne dannes mellem carbonyloxygener og amidhydrogener af tilstødende polypeptidkæder, der kører på en parallel eller anti-parallel mode, hvilket resulterer i en arklignende struktur.

Mens brintbindinger er den primære drivkraft for sekundær struktur, kan andre interaktioner også bidrage, såsom:

* ioniske interaktioner: Disse forekommer mellem ladede aminosyresidekæder.

* Hydrofobe interaktioner: Disse forekommer mellem ikke -polære aminosyresidekæder og skubber dem sammen og væk fra vandet.

* van der Waals Forces: Dette er svage attraktioner mellem molekyler, men de kan kollektivt bidrage til stabiliteten i sekundære strukturer.

Det er vigtigt at bemærke, at disse interaktioner er svagere end kovalente bindinger, men de er stadig afgørende for at opretholde den specifikke form og stabilitet af proteinets sekundære struktur.