Hvorfor bruge formaldehyd i det nordlige blotting til tilberedning af gel?

Her er hvorfor:

* Northern Blotting bruger en agarosegel, ikke en polyacrylamidgel. Polyacrylamidgeler anvendes i SDS-PAGE (natriumdodecylsulfatpolyacrylamidgelelektroforese), der adskiller proteiner efter størrelse. Formaldehyd bruges i nogle SDS-PAGE-protokoller til at opretholde integriteten af ​​proteinstruktur.

* Northern blotting mål RNA, ikke proteiner. RNA adskilles efter størrelse ved hjælp af en agarosegel, ikke en polyacrylamidgel. Formaldehyd er ikke nødvendigt for at opretholde RNA -struktur i denne sammenhæng.

Her er hvad der bruges i det nordlige blotting gelforberedelse:

* Agarose: Et polysaccharid, der danner en gelmatrix, der adskiller RNA -molekyler efter størrelse.

* buffer: Typisk Tris-Borate-EDTA (TBE) eller Tris-acetat-EDTA (TAE) -buffer, hvilket tilvejebringer et ledende medium til elektroforese.

* formaldehyd (valgfrit): Formaldehyd tilsættes undertiden * til elektroforese -bufferen under det nordlige blotting, men dette er ikke for at tilberede selve gelen. Det bruges til at denaturere RNA -molekylerne, hvilket sikrer, at de migrerer gennem gelen baseret på størrelse alene, ikke struktur.

Kortfattet: Formaldehyd spiller ingen rolle i det nordlige blotting gelforberedelse. Det bruges i nogle protokoller til denature RNA -molekyler under elektroforese, men ikke i selve gelen.