* Atomet er for det meste tomt rum: Det faktum, at de fleste alfapartikler passerede lige gennem guldfolien uden at blive afbøjet, betød, at atomet ikke var en fast, uigennemtrængelig sfære, som tidligere antaget. I stedet skal det for det meste være tomt rum.
* Atomet har en lille, tæt, positivt ladet kerne: De få alfa -partikler, der blev afbøjet i store vinkler, indikerede tilstedeværelsen af en meget lille, tæt, positivt ladet region inden for atomet, som han kaldte kernen. Denne kerne er ansvarlig for at indeholde næsten al atomens masse.
* Elektroner kredser om kernen: Rutherfords model antydede, at elektroner kredsede om kernen som planeter kredsede solen. Imidlertid blev denne model senere revideret af Bohr og andre for at redegøre for elektronernes kvante karakter.
I sammendraget væltede Rutherfords eksperiment den blommepudding -model for atomet og førte til udviklingen af den nukleare model, som forbliver grundlaget for vores forståelse af atomstruktur.