Videnskab
 Science >> Videnskab & Opdagelser >  >> Kemi

Hvad er en følgende reaktioner, der bruges til radioaktivt at mærke DNA?

Der er flere metoder til radioaktivt at mærke DNA, der hver anvender forskellige reaktioner og isotoper. Her er et par almindelige tilgange:

1. Nick -oversættelse:

* reaktion: Denne metode bruger enzymet DNA -polymerase I At erstatte nukleotider i en DNA -streng med mærkede nukleotider. Det fungerer ved at introducere enkeltstrengede pauser (nicks) i DNA'et ved hjælp af DNase I . Polymerasen bruger derefter nikken som en primer og inkorporerer mærkede nukleotider i kløften.

* isotoper: Almindelige anvendte isotoper er ³²p-dctp eller ³²p-datp .

* Fordele: Producerer høj specifik aktivitet (etiketdensitet) og er velegnet til både enkelt- og dobbeltstrenget DNA.

* Ulemper: Kræver et specifikt enzym og kan være følsomt over for bufferforholdene.

2. Tilfældig primermærkning:

* reaktion: Denne metode bruger korte tilfældige oligonukleotidprimere og DNA -polymerase I (Klenow Fragment) til syntetiserende en ny DNA -streng komplementær til skabelonstrengen. Polymerasen inkorporerer mærkede nukleotider under syntesen.

* isotoper: Almindelige anvendte isotoper er ³²p-dctp eller ³²p-datp .

* Fordele: Effektiv og kan bruges til at mærke både enkelt- og dobbeltstrenget DNA.

* Ulemper: Kan introducere en vis baggrundsmærkning på grund af den tilfældige primerbinding.

3. Slutmærkning med kinaser:

* reaktion: Denne metode bruger polynukleotidkinase At tilføje en phosphatgruppe i 5 'enden af et DNA -fragment. Fosfatgruppen er mærket med en radioaktiv isotop.

* isotoper: Typisk ³²p-atp eller ³³p-atp bruges.

* Fordele: Enkel og ligetil, især nyttig til mærkning af korte DNA -fragmenter.

* Ulemper: Kun etiketter 5 'enden af DNA.

4. PCR -mærkning:

* reaktion: Denne metode involverer anvendelse af radioaktive dntps (såsom ³²p-dctp ) under PCR -reaktionen. Dette inkorporerer etiketten i de nyligt syntetiserede DNA -strenge.

* isotoper: Almindelige anvendte isotoper er ³²p-dctp eller ³²p-datp .

* Fordele: Effektiv og kan bruges til at mærke specifikke DNA -sekvenser.

* Ulemper: Kan være mindre effektiv end andre metoder og kan være vanskelige at opnå høj specifik aktivitet.

5. In vitro -transkription:

* reaktion: Bruger RNA -polymerase Sådan transkribere en DNA -skabelon til RNA. RNA er mærket med radioaktive nukleotider under syntesen.

* isotoper: Typisk ³²p-Utp eller ³⁵s-utp .

* Fordele: Kan producere højt mærkede RNA -prober til hybridiseringsundersøgelser.

* Ulemper: Kræver specialiserede reagenser og betingelser for in vitro -transkription.

Valget af mærkningsmetode afhænger af den specifikke anvendelse og de ønskede egenskaber ved det mærkede DNA.

Bemærk: Brugen af radioaktive isotoper er faldet i de senere år på grund af sikkerhedsmæssige bekymringer og tilgængeligheden af ikke-radioaktive mærkningsmetoder. Radioaktiv mærkning har dog stadig nogle fordele i visse anvendelser, især for følsomhed og evnen til at detektere mål med lav overflod.

Varme artikler