Svampelignende koraller får deres genom kortlagt

Genomsekvenserne af to "falske" koraller giver et vindue ind i udviklingen af ​​forkalkning, som kan hjælpe deres fætre, der bygger rev.

Svampepolypper. Elefant øre koraller. Skiveanemoner. Uanset hvad du vil kalde dem - videnskabsmænd foretrækker korallimorfer - disse hvirvelløse akvariedyr er blandt de nærmeste kendte slægtninge til koraller, der bygger rev. Et hold ledet af forskere fra Red Sea Research Center ved KAUST har nu sekventeret hele genomerne fra to sådanne "nøgne" koralarter, såkaldte, fordi de ikke nedlægger calciumcarbonatskeletter.

DNA-kort giver et vindue ind i udviklingen af ​​forkalkning og kan hjælpe videnskabsmænd med at redde verdens koralrev fra udryddelse.

"Dette er de første genomer, der er offentliggjort fra denne gruppe af organismer, " sagde Manuel Aranda, en adjunkt i havvidenskab ved KAUST, der ledede genomprojektet. "De ressourcer og analyser, vi leverer, er grundlaget for fremtidige undersøgelser, der sigter på at forstå, hvordan koraller udviklede evnen til at bygge et af de mest produktive og biodiverse økosystemer på vores planet."

Aranda gik sammen med forskere ved det videnskabelige center i Monaco for at udvinde DNA fra vævsprøver af Amplexidiscus fenestrafer og Discosoma sp., to korallimorfer med en form som jordbaserede svampe. Xin Wang, en ph.d. studerende i Arandas laboratorium, arbejdede derefter sammen med teknikere på KAUST Bioscience Core Facility for at sekvensere, samle og annotere begge arters genomer. De udpegede alle generne i de corallimorfe genomer ved at lede efter sekvenslighed med kendte gener fundet i andre arters genomer, inklusive dem af to søanemoner og en koral.

På denne måde de bekræftede, at korallimorfer er de nærmeste levende slægtninge til koraller, der bygger rev, giver en tiltrængt genomisk ressource til at udfylde det evolutionære hul mellem søanemoner og koraller. De viste også, at A. fenestrafer-genomet er cirka 370 millioner DNA-bogstaver langt med 21, 372 gener, og at genomet af A. Discosoma er 445 millioner nukleotider langt med 23, 199 gener. Disse størrelser er mellem dem for søanemoner og koraller, i overensstemmelse med den evolutionære historie og kompleksitet af denne taksonomiske gruppering.

Forskere overalt kan nu frit få adgang til og gennemse begge nye corallimorph genom-kort via en online platform tilgængelig på corallimorpharia.reefgenomics.org.

Aranda håber, at forskersamfundet vil bruge genomsekvenserne til bedre at forstå den evolutionære oprindelse af generne, der gjorde det muligt for koraller at blive de økosystembyggere, de er i dag. I sit laboratorium, for eksempel, Aranda og hans team udforsker de evolutionære innovationer, som koraller var nødt til at lave for at opnå evnen til at forkalke. "Indtil nu, " sagde Wang, "Vi har fundet flere gener involveret i forkalkning, som er blevet unikt duplikeret i koraller."