Identificering af superkoraller gennem DNA -analyse

En ph.d. studerende fra EPFL vil tilbringe tre måneder i Ny Kaledonien til et forskningsprojekt støttet af International Coral Reef Initiative. Han vil dele sin erfaring på bloggen EPFL Out There.

Oliver Selmoni, et andet års ph.d. studerende på EPFL, får tre måneder til at indsamle 400 koralrevsprøver i Ny Kaledonien. Denne franske øhav ligger direkte øst for Australien og er omgivet af det næststørste koralrev i verden efter Great Barrier Reef. Som så mange andre koralrev, dette dyrebare økosystem - som er på UNESCOs verdensarvsliste - er truet. Den 20. februar, Selmoni vil slutte sig til et forskningsinitiativ lanceret af EPFL om, hvordan koraller tilpasser sig den globale opvarmning, forurening og antropisering af kystområder. Projektet udføres i samarbejde med det franske nationale forskningsinstitut for bæredygtig udvikling (IRD - UMR ENTROPIE). Han vil sende opdateringer, fotos og videoer til EPFL Out There blog og Instagram indtil slutningen af ​​maj.

Selmonis forskningsprojekt kombinerer genetik og geografi:han vil anvende en ny videnskabelig metode kendt som seascape genomics på koralrev. Denne tilgang bruger DNA -prøver fra koraller til at identificere potentielle sammenhænge mellem genetisk variation og en bestemt miljøtilstand. Ved prøveudtagning af individuelle prøver, der kan have været påvirket af blegning af to arter af koraller (Acropora millepora og Pocillopora damicornis), Selmoni håber at opdage genetiske mutationer, der kan sætte koraller i stand til at modstå global opvarmning og forsuring af havet. Koralprøver med denne mutation kunne derefter rejses i en planteskole og bruges til at genbefolke de beskadigede dele af rev. Ved krydshenvisning til DNA og geografiske data, Selmoni vil også kunne kortlægge revene omkring øen, som er 300 kilometer lang og 30 kilometer bred. Dette kort vil understøtte bestræbelserne på at udvikle bevaringsstrategier og hjælpe med at identificere, hvor den superkoral, som Selmoni håber at opdage, vil være mest effektiv, når den genplantes. Dette projekt er et af seks - valgt blandt 230 forslag - der skal støttes af International Coral Reef Initiative, en FN -partner.

Dykning for at udtrække DNA

Selmoni vil bruge de næste tre måneder på at dykke efter koralprøver på omkring 20 steder. Han vil blive assisteret af en bådpilot og to professionelle dykkere. Hans forskning vil føre ham til Ny Kaledoniens "sædvanlige" distrikt, hvor de indfødte stammer vil forvente, at han betaler en traditionel told i form af mad og andre varer for at komme ind på deres område. Mellem dyk, forskeren vil udtrække DNA i laboratoriet, ved hjælp af udstyr leveret af IRD's center i hovedstaden Nouméa. Hans arbejde i Ny Kaledonien vil blive overvåget af Véronique Berteaux-Lecellier, en forsker i koralgenetik ved det franske nationale center for videnskabelig forskning (CNRS), som også er hans afhandling meddirektør.

Selmoni afsluttede en kandidatgrad i bioinformatik ved University of Lausanne, inden han tog sin ph.d. forskning ved EPFL i Laboratory of Geographic Information Systems (LASIG), som ledes af forsknings- og undervisningsassistent Stéphane Joost. Selmoni, hvem er fra Lugano, først lært om koralblegning og restaurering under en to måneders praktik på et forskningscenter på Ko Pha-ngan-øen i Thailandsbugten. I erkendelse af den vigtige betydning af dette smukke og komplekse økosystem, han besluttede at vie sit speciale til det.