Harvey-prøver sadlet med antibiotikaresistente gener

Forskere fra Rice University har frigivet de første resultater af omfattende vandprøver i Houston efter den episke oversvømmelse forårsaget af orkanen Harvey. De fandt udbredt forurening af E coli , sandsynligvis resultatet af overløb fra oversvømmede rensningsanlæg.

Den mikrobielle undersøgelse viste høje niveauer af E coli , en fækal indikatororganisme, fanget i hjem, der stadig indeholdt stillestående vand uger efter stormen, samt høje niveauer af centrale gener, der angiver antibiotikaresistens.

Undersøgelsen ledet af Rice miljøingeniør Lauren Stadler optræder i American Chemical Society journal Environmental Science &Technology Letters . Et par National Science Foundation RAPID -tilskud hjalp teamet med at indsamle og analysere prøver.

Ris miljøingeniører Stadler, Qilin Li og Pedro Alvarez og deres elever var i frontlinjen, selv før Harvey faldt, at tage prøver fra oversvømmelser nær de overfyldte Brays og Buffalo bayous, i offentlige rum og inden for og uden for beboelseshuse for at sammenligne deres mikrobielle indhold. Prøver af stillestående vand blev taget fra hjem, der havde været lukket i mere end en uge, mens andre blev taget fra hjem, der havde oversvømmelsesvand gennem dem.

Tidlige prøver fra hvert sted bar forhøjede niveauer af E coli . Men mest påfaldende var det faktum, at prøveudtagning af vand og senere, sediment viste rigelige niveauer af to indikatorgener, sul1 og intI1, der markerer tilstedeværelsen af ​​antibiotikaresistente bakterier, selv uger efter oversvømmelsen. I særdeleshed, prøver fra oversvømmelser inde i lukkede hjem viste, at koncentrationer af sul1 var 250 gange større og intI1 60 gange større end i bayou -prøver.

"Sul1 er et gen, der giver resistens over for sulfonamidantibiotika, sagde Stadler, en adjunkt i civil- og miljøteknik. "IntI1 er ikke et antibiotikaresistent gen, men et integron-integrase-gen, der koder for et system for genfangst og -spredning og kan føre til spredning af antibiotikaresistente gener blandt bakterier. Mange antibiotikaresistente gener er på eller forbundet med mobile genetiske elementer som plasmider, der kan deles mellem bakterier.

"Vi retter os mod intI1, fordi integroner ofte findes på mobile genetiske elementer og angiver den genetiske mobilitet af et gen, "sagde hun." De er også ofte forbundet med antibiotikaresistens, og overflod af disse gener giver os en fornemmelse af potentialet for vandret genoverførsel blandt bakterier.

"Det betyder noget, for mens vi hele tiden ser disse gener i miljøbakterier, vi bekymrer os virkelig, når patogene bakterier erhverver resistente gener fra miljøbakterier, "Stadler sagde." Det er når der er et problem-når der er et antibiotikaresistent patogen. Hvis du udsættes for en af ​​dem, det er, når du ser infektioner, der er virkelig svære at behandle. "

Den umiddelbare takeaway fra undersøgelsen, hun sagde, er, at folk skal være ekstra forsigtige med at undgå direkte kontakt med stillestående flodvand, især i oversvømmede hjem med nicher, så patogener kan vokse.

"Brug beskyttelsesudstyr, og gå slet ikke ind, hvis du er immunkompromitteret eller har åbne sår, " hun sagde.

Stadlers forskergruppe bruger erfaringerne fra Harvey til at fremme udviklingen af ​​værktøjer til måling af horisontal genoverførsel, når den finder sted i miljøet.