Tsetse-fluer får infektionen, når de lever af blodet fra et inficeret dyr. Parasitterne gennemgår udvikling inden for fluen, og efter en periode bliver fluen smitsom. Når en inficeret flue bider et andet dyr, overføres parasitterne gennem fluens spyt og kommer ind i blodbanen hos den nye vært.
Inden for den nye vært formerer parasitterne sig og spredes gennem blodbanen og væv, hvilket forårsager en række symptomer, herunder feber, svaghed, vægttab, anæmi og neurologiske problemer. Hvis nagana ikke behandles, kan det være dødeligt.
Overførsel af nagana fra tsetse-fluer er en kompleks proces, der involverer flere faktorer, herunder arten af tsetse-flue, arten af Trypanosoma-parasitten og værtsdyrets immunrespons. Forskellige arter af tsetse-fluer har forskellige grader af modtagelighed for infektion med forskellige arter af trypanosoma, og nogle dyrearter er mere modtagelige for sygdommen end andre.
Bekæmpelsen af nagana er udfordrende på grund af den brede udbredelse af tsetse-fluer og vanskeligheden ved at behandle og forebygge sygdommen. Forskellige metoder bruges til at kontrollere sygdommen, herunder brug af insekticider til at dræbe tsetsefluer, brug af lægemidler til behandling af inficerede dyr og brug af fælder og andre metoder til at reducere kontakt mellem tsetsefluer og husdyr.