Forskere udvikler ny sensor til methyleret DNA

Samarbejdspartnere fra Mayo-Illinois Alliance for Technology Based Healthcare har udviklet en ny, enkelt molekyle test til påvisning af methyleret DNA. Methylering - tilføjelsen af ​​en methylgruppe af molekyler til en DNA-streng - er en af ​​måderne, hvorpå genekspression reguleres. Resultaterne fremgår af det aktuelle nummer af Videnskabelige rapporter .

"Mens nanoporer er blevet undersøgt til genomisk sekventering og screeningsanalyse, denne nye analyse kan potentielt omgå behovet for nogle af de nuværende processer til evaluering af epigenetik-relaterede sygdomme, " siger George Vasmatzis, Ph.D., medleder af Mayos Biomarker Discovery Program i Center for Individualiseret Medicin og medforfatter på artiklen. Han siger, at analysen kunne eliminere behovet for bisulfitomdannelse af DNA, fluorescerende mærkning, og polymerasekædereaktion (PCR).

"Næste trin inkluderer at øge den rumlige opløsning ved at inkorporere tyndere membraner og ved at integrere de samme forberedelsestrin, " siger Rashid Bashir, Ph.D., professor i bioteknik, direktør for mikro- og nanoteknologilaboratoriet, og co-lead forfatter af undersøgelsen ved University of Illinois i Urbana-Champaign.

En nanopore, I dette tilfælde, er et meget lille hul i en kunstig membran, der kun tillader et enkelt molekyle at blive lokaliseret og identificeret. Forskere siger, at dette er nyttigt, da methylering i promotorsekvenser kan indikere tumorudvikling i de fleste hovedtyper af cancer og kan være en bedre biomarkør end mange genetiske markører. Forskere er nu i stand til at differentiere methyleret fra ikke-methyleret DNA ved at vedhæfte et protein på de methylerede nukleotider, der måler ionisk elektrisk strøm via en solid state nanopore.