Videnskab
 Science >> Videnskab >  >> nanoteknologi

CRONT:Styrkende optisk pincet med biometriske øjne

a, Den diagrammatiske skitse af de tre komponenter i opløsningen:DNA@AuNS-konjugat, CRISPR/Cas12a-kompleks og mål-ssDNA. b, Optisk opsætning, BS, SPF og TL er henholdsvis stråledeler, kortpasfilter og rørlinse (f=200 mm). Yderligere detaljer om opsætningen findes i afsnittet Materialer og metoder. c, Dispersion af de tre komponenter i opløsningen uden optisk opvarmning. d, Optotermisk nettokraft (F Net ) induceret migration og DNA@AuNS-konjugatspaltning ved optisk opvarmning, er opvarmningslaserens effekt 0,5 mW. e, Observation af spaltningen efter at den optiske opvarmning er slukket. Kredit:Jiajie Chen, Zhi Chen, Changle Meng, Jianxing Zhou, Yuhang Peng, Xiaoqi Dai, Jingfeng Li, Yili Zhong, Xiaolin Chen, Wu Yuan, Ho-Pui Ho, Bruce Zhi Gao, Junle Qu, Xueji Zhang, Han Zhang &Yonghong Shao

Optotermiske nanoweezer, en innovativ optisk manipulationsteknik i løbet af det sidste årti, har revolutioneret klassisk optisk manipulation ved effektivt at fange et bredere spektrum af nanopartikler. Selvom denne teknik primært er blevet brugt til in-situ manipulation af nanopartikler, forbliver dens potentiale til at identificere bio-nanopartikler stort set uudforsket.



Heri, baseret på de synergistiske virkninger af optotermisk manipulation og CRIPSR-baseret biodetektion, udviklede forfattere CRISPR-drevne optotermiske nanoweezere (CRONT). Specifikt, ved at udnytte diffusioforese og termo-osmotiske strømme nær substratet ved optotermisk excitation, fangede og berigede forfattere bio-nanopartikler med succes, herunder guldnanopartikler, CRISPR-associerede proteiner samt DNA-molekyler.

I en nylig udgivelse offentliggjort i Light:Science &Applications , et team af videnskabsmænd ledet af professor Jiajie Chen, Zhi Chen, Zhang Han, Yonghong Shao fra Shenzhen University, sammen med deres samarbejdspartnere, har professor Ho-Pui Ho fra The Chinese University of Hong Kong udtænkt en optotermisk tilgang til at forbedre CRISPR-baseret enkelt-nukleotid polymorfi (SNP) påvisning for at opnå enkelt molekyle niveau.

Desuden har de introduceret en ny CRISPR-metode til at observere nukleotidspaltning. Desuden har denne innovative tilgang udstyret optiske pincet med DNA-identifikationsevne i vandig opløsning, som var uopnåelig før. På grund af dens bemærkelsesværdige specificitet og gennemførlighed for in-situ manipulation og identifikation af bio-nanopartikler, er den klar til at blive et universelt værktøj inden for point-of-care diagnose, biofotonik og bio-nanoteknologi.

CRONT kan udsøgt indstilles til at manipulere bio-nanopartikler og opfylde arbejdsbetingelserne for CRISPR-baseret mål bio-nanopartikel identifikation. Specifikt, ved at inkorporere optotermisk-induceret diffusioforetisk kraft, har forfattere med succes manipuleret bio-nanopartikler, herunder ssDNA, dsDNA, BSA, Cas12a-protein og DNA-funktionaliserede guld-nanopartikler.

Ved at inkorporere en CRISPR-baseret DNA-biosensing-tilgang, hvor spaltningen af ​​et enkelt indfanget DNA@Gold-nanopartikel-konjugat afhøres, forvandlede forfatterne denne optotermiske pincet til en molekylær sonde for in-situ DNA-molekylerne (SARS-CoV-2 eller Monkeypox) identifikation uden nukleinsyreamplifikation og opnåede detektionsgrænser på 25 aM for ssDNA og 250 aM for dsDNA.

a, Et enkelt DNA@AuNS fanges af CRONT ved laseropvarmningsområdet. Opvarmningslaseren slukkes ved 28,8 sekunder, og spaltning observeres efterfølgende. b, Indfangningsstivhedsmålinger ved varierende lasereffekter i x/y-retning, hvor den stiplede linje angiver den maksimale stivhed ved 0,5 mW. c, Positionsfordeling af det fangede enkelt DNA@AuNS ved 0,5 mW. d, Lysintensitetsvariation af et fanget DNA@AuNS under laseraktiveringen. Mål-ssDNA'et er fra en del af Monkeypox (MP)-virussekvensen. Rammer blev optaget ved hjælp af mørkfeltsmikroskopi, og skalaen er 2 μm. e, Spaltningssandsynlighed for DNA@AuNS ved forskellige target ssDNA (MP) koncentrationer. f, Spaltningssandsynlighed ved forskellige crRNA- og mål-ssDNA-kombinationsgrupper (A-E) til specificitetstest, mål-ssDNA-koncentrationerne er 250 fM. g, Spaltningssandsynlighed for DNA@AuNS ved forskellige mål-dsDNA (MP)-koncentrationer. Den optiske effekt indstillet til 0,5 mW i a, c-g. h, Spaltningssandsynlighed for DNA@AuNS under dsDNA ved en lavere optisk effekt på 0,16 mW, det indsatte angiver temperaturfordelingen. Hver fangsthændelse blev udført i 2 minutter, og hvert datapunkt omfattede 10-17 fangsthændelser over en 40-minutters periode. Hver koncentration blev testet tre gange. PEG-massefraktionen er 10%. Koncentrationen af ​​AuNS og Cas12a er henholdsvis 0,5 μM og 0,125 nM. Kredit:Jiajie Chen, Zhi Chen, Changle Meng, Jianxing Zhou, Yuhang Peng, Xiaoqi Dai, Jingfeng Li, Yili Zhong, Xiaolin Chen, Wu Yuan, Ho-Pui Ho, Bruce Zhi Gao, Junle Qu, Xueji Zhang, Han Zhang &Yonghong Shao

Bemærkelsesværdigt har de vist, at disse nanotweezere tilbyder identifikation af enkeltnukleotidpolymorfismer (SNP'er) ved ultralavere detektionsvolumener (10 μL), som spiller en afgørende rolle i genetisk diversitet og er forbundet med forskellige fænotypiske træk, herunder sygdomsmodtagelighed og lægemiddelrespons. Derfor er denne innovation inden for SNP-detektionsteknikker afgørende for at imødekomme de forskellige krav fra genomisk forskning og medicinske anvendelser i fremtiden.

Disse forfattere opsummerede CRONT's arbejde og udsigter som følger:

"CRONT har muliggjort den øjeblikkelige implementering af CRISPR-baseret biosensing inden for ultra-lav detektionsvolumen. Optiske pincet er nu udstyret med DNA-identifikationsevne gennem det CRISPR-baserede biosensing-system. CRONT's lokaliserede opvarmningsegenskaber har ikke kun givet mulighed for biomolekyler berigelse, men også et nødvendigt termisk miljø for spaltningen af ​​CRISPR-komplekset."

"Yderligere udvikling af dette optotermiske-baserede CRISPR bio-detektionsskema kan involvere brugen af ​​en række laseropvarmningspunkter til parallel high-throughput detektion, hvilket gør teknikken mere velegnet til kvantitativ detektion og væsentligt reducerer detektionstiden. CRONT kan også være ansat til at guide CRIPSR/Cas-komplekset til mål-DNA'et og initiere genredigeringsprocessen. Det giver også forskerne mulighed for at overvåge genredigeringsprocessen i realtid på enkeltmolekyleniveau," tilføjede de.

"Vi forventer, at sådanne ikke-kontakt nanoprober vil bidrage til en dybere forståelse af forskellige komplekse biologiske processer, højlysende optiske, termiske, biologiske ligheder på enkeltpartikelniveau."

Flere oplysninger: Jiajie Chen et al., CRISPR-drevne optotermiske nanotweezere:Diverse bio-nanopartikelmanipulation og enkeltnukleotididentifikation, Light:Science &Applications (2023). DOI:10.1038/s41377-023-01326-9

Leveret af Chinese Academy of Sciences




Varme artikler