Her er hvordan:
* skiftede nedbørsmønstre: El Niño -begivenheder har en tendens til at skifte nedbørsmønstre, hvilket fører til øget nedbør i nogle områder (som det sydlige USA) og nedsat regn hos andre (som de store sletter). Dette kunne have bidraget til de allerede tørre forhold i støvskålens region i 1930'erne.
* Forøgede temperaturer: El Niño kan også medføre højere temperaturer i visse regioner, hvilket fører til hurtigere fordampningshastighed og tørrere jord, hvilket yderligere forværrer tørkeforholdene i støvskålen.
* Forøgede vindhastigheder: El Niño kan undertiden være knyttet til stærkere vinde i visse områder. Disse stærke vinde kunne have bidraget til erosion af jordbund, hvilket førte til støvstorme, der var karakteristiske for støvskålen.
Det er dog vigtigt at huske, at støvskålen primært var forårsaget af en kombination af menneskelige-inducerede faktorer , såsom:
* Over-landbrug: Intensiv landbrugspraksis, som at pløje landet og fjerne indfødte græs, efterlod jordbunden udsat og sårbar over for vind erosion.
* Tørke: I 1930'erne så en langvarig tørke i de store sletter, tørre jorden ud og gøre den modtagelig for støvstorme.
Derfor, selvom El Niño måske har spillet en lille rolle i forværringen af støvskålforholdene, var det ikke den primære årsag. Støvskålen var primært en konsekvens af menneskelige handlinger, der førte til jordforringelse og uholdbar landbrugspraksis.