Forskere ved Los Alamos National Laboratory og flere andre institutioner har karakteriseret en prøve af "mystisk" svamp og fundet sit hjem i livets svampetræ. Svampens nøjagtige placering i den taksonomiske orden var ukendt indtil nu. Los Alamos National Laboratory udfører en bred vifte af biologiske forskningsindsatser som en del af sin nationale sikkerhedsvidenskabelige mission, med sådan forskning som fylogenetisk analyse, der hjælper med at bestemme sikre patogener og sygdomsoverførselsveje. Kredit:Los Alamos National Laboratory
I et skridt mod at bygge bro mellem svampetaksonomi og molekylær økologi, videnskabsmænd fra flere institutioner, herunder Los Alamos National Laboratory, har karakteriseret en prøve af "mystisk" svamp indsamlet i North Carolina og fundet sit hjem i livets svampetræ.
"Arbejdsestimater fortæller os, at der burde være mere end 5 millioner arter af svampe, " sagde Cheryl Kuske, en Los Alamos-videnskabsmand på projektet. "Vi har egentlig kun identificeret og fuldt ud beskrevet 100, 000 af dem, selvom, og nye DNA-sekventeringsevner viser os, at mange, mange eksemplarer i forskningssamlinger er ukarakteriserede. At løse dette særlige mysterium viser den potentielle værdi af at bruge miljøsekvensering til at vejlede taksonomiske og økologiske opdagelser."
Svampeprøven var interessant til dels, da den repræsenterede en hovedkomponent af den observerede svampepopulation i en fyrreskov, og den reagerede positivt på forhøjede CO2- og nitrogenændringsbehandlinger, der efterligner fremtidige miljøforhold - men prøvens nøjagtige placering i den taksonomiske rækkefølge var ukendt. Prøven fik til sidst et nyt navn, Bifiguratus adelaidae , som rapporteret for nylig i bladet Mycologia .
Hvorfor var det svært? I tider, hvor en simpel kindpodning sendt afsted med en check kan producere en menneskelig DNA-rapport, der viser tusindvis af forfædre, en prøveidentifikation synes at være en simpel opgave. Men som en leder i tidsskriftet påpegede, denne prøve repræsenterede en af mange "mørk stof svampe", der befolker ukendte områder af livets svampetræ. Vi kan påvise deres DNA i miljøprøver, men deres kultur har været undvigende.
Som nævnt i tidsskriftets leder, "Denne placering er særligt spændende på grund af den øgede forståelse af mykorrhiza-rollen (evnen til at danne symbiotisk, næringsstof-overførselsforhold) for denne del af fylogenien og det faktum, at man ved meget lidt om artsdiversiteten og udbredelsen i denne del af træet. Bifiguratus adelaidae kan have en symbiotisk funktion i rødderne, er blevet påvist i orkidé- og kastanjerødder, men det er også veldokumenteret i jord fra nordlige tempererede zoner."
Interessant nok, den indsamlede prøve var kun blevet dyrket med succes i laboratoriet, når den fik lov til at vokse i selskab med en bakterieart, Methylobacterium , at antibiotika ikke var i stand til at dræbe. Normalt ville svampeprøven være blevet renset for sådanne kontaminanter, men denne modstod deres forsøg. Forfatterne hævder, at de symbiotiske eller kommensale mikrobers tilstedeværelse kan være en del af dyrkningssuccesen. Forståelsen af komplekse mikrobielle og svampesamfund skrider frem, Kuske bemærkede, ved at lade organismer vokse som definerede blandinger.
Los Alamos National Laboratory udfører en bred vifte af biologiske forskningsindsatser som en del af sin nationale sikkerhedsvidenskabelige mission, med sådan forskning som fylogenetisk analyse for at bestemme sikre versus farlige patogener og for at identificere sygdomsoverførselsveje.
Det Bifiguratus adelaidae blev navngivet til ære for Adelaida Chaverri Polini. Dr. Chaverri var en verdensanerkendt tropebiolog og rollemodel for kvinder i Latinamerika inden for videnskab, teknologi, ingeniørarbejde, og matematik. Hendes vigtigste bidrag var i undersøgelsen og bevarelsen af tropiske bjergskove og træløse alpine græsarealer (páramos). Som biolog, hun anerkendte betydningen af mykorrhizasvampe og bidrog til beskrivelsen af en svamp i Acaulosporaceae , en svamp i samme phylum som arten beskrevet i dette papir. Hun støttede oprettelsen af Costa Ricas National Park Service, skabe grundlag for omfattende bevarelse af den biologiske mangfoldighed. I 2013 hun var inkluderet i Galería de la Mujer, en af de højeste udmærkelser givet til costaricanske kvinder for deres dedikation til at forsvare og forbedre kvinders menneskerettigheder.