Dokumentering af verdens afgrødediversitet og gør den tilgængelig

Genbanker spiller en vigtig rolle i den langsigtede bevarelse af plantegenetiske ressourcer til fødevarer og landbrug. Ud af 1.800 genbanksamlinger på verdensplan er mere end 600 i Europa. Denne enorme vifte af afgrødediversitet kan kun udnyttes til at gøre vores afgrøder mere nærende, produktive og modstandsdygtige over for skadedyr, sygdomme og miljøændringer, hvis vi har information om det.

Det europæiske søgekatalog for plantegenetiske ressourcer (EURISCO) er en international aggregeret database, der giver et centralt indgangspunkt for information om den store genetiske mangfoldighed af afgrøder, der er bevaret i mere end 400 institutter i 43 europæiske lande og nabolande.

En opdatering om EURISCO er for nylig blevet offentliggjort i Nucleic Acids Research (NAR) specialnummer om biologiske databaser.

I øjeblikket er mere end 2 millioner plantegenetiske ressourcetilslutninger dokumenteret i EURISCO, der omfatter 6.737 slægter og 45.175 arter. Disse omfatter store kornsorter som hvede og majs, bælgfrugter som bønner, ærter og vikker, spiselige oliefrøafgrøder som solsikke og hørfrø, knoldafgrøder som kartofler og Brassica-afgrøder.

Mere end 400.000 tiltrædelser er en del af det multilaterale system for adgang og fordeledeling (MLS) af den internationale traktat om plantegenetiske ressourcer for fødevarer og landbrug (ITPGRFA), hvilket betyder, at de er blevet bekræftet af de respektive lande til at være straks tilgængelige under standard og internationalt aftalte fordelsdelingsbetingelser. Derudover er der 2,6 millioner registreringer af fænotypiske data fra mere end 3.800 eksperimenter udført på genbankmateriale.

Siden den første offentliggørelse i NAR Database Issue i 2017 er datamængden i EURISCO blevet udvidet kontinuerligt:​​Antallet af dataleverandørinstitutioner steg fra 376 til 402, antallet af dokumenterede tiltrædelser steg med mere end 200.000, og antallet af fænotypiske datapunkter steg med 2,2 millioner (500%).

"Dette viser, at EURISCO støt vinder accept som et lager af sådanne data," siger Stephan Weise, EURISCO-koordinator. "Derudover bliver dataene om plantegenetiske ressourcer løbende vedligeholdt og udvidet af dataleverandørerne. Hvert år opdateres mellem 30 og 40 National Inventory-datasæt i EURISCO, for et gennemsnit på 350.000-400.000 tiltrædelser om året. Med European Cooperative Program for Plant Genetic Resources (ECPGR), vi organiserer træningsworkshops for at støtte dataleverandører og i sidste ende forbedre datakvaliteten."

I begyndelsen af ​​2022 blev EURISCOs brugergrænseflade fuldstændigt revideret og inkluderer en kombineret søgning via pas og fænotypiske data, facetteret søgning, kortbaserede valgmuligheder for tilslutninger samt søgeindekser for videnskabelige navne og almindelige afgrødenavne.

I 2023 vil EURISCO også gennemføre en udvidelse til at inkludere data om in situ afgrøder vilde slægtninges populationer, som er en nøgleressource for afgrødeforbedringsprogrammer.

"EURISCO er en hjørnesten i det europæiske informationssystem for plantegenetiske ressourcer, og dets videre udvikling og styrkelse er nøglemål for strategien for plantegenetiske ressourcer for Europa," konkluderede Lorenzo Maggioni, ECPGR-sekretær. + Udforsk yderligere

Ny viden i historien:Evaluering af syv årtiers ex situ frø-regenerering