Forskere ledet af prof. Zhang Zairong fra Shanghai Institute of Organic Chemistry ved det kinesiske videnskabsakademi har identificeret en post-translationel topogenese-vej til foldning og samling af multi-spændende membranproteiner (MSP'er).
Ud af de omkring 5.000 membranproteiner, der syntetiseres ved den endoplasmatiske reticulum (ER) membran af menneskelige celler, er mere end halvdelen MSP'er, der spiller kritiske roller i cellulær og organismefysiologi, og fungerer som ionkanaler, transportører, receptorer og intramembrane enzymer.
En betydelig del af disse funktioner er afhængige af polære og ladede aminosyrer, hvilket fører til dannelsen af dårligt hydrofobe TMD'er (pTMD'er). Imidlertid står pTMD'er over for udfordringer med at blive genkendt og integreret i phospholipid-dobbeltlaget af Sec61-translokonet, som foretrækker hydrofobe TMD'er.
I det humane proteom indeholder ca. 30 % af membranproteiner og mere end 50 % af MSP'er mindst én pTMD. Hvordan disse pTMD'er effektivt identificeres og pakkes præcist ind i modne MSP-strukturer har været et stort videnskabeligt spørgsmål.
Ved at bruge den seks-spændende protein adenosin triphosphat-bindende kassettetransporter G2 (ABCG2) som en model, fandt forskerne, at under co-translationel translokation passerer ABCG2's pTMD2 gennem den centrale pore af translokonet ind i ER-lumenet i stedet for at blive integreret i fosfolipid-dobbeltlaget gennem translokonets laterale gate.
Dette resulterer i indsættelse af nedstrøms TMD'er i ER-membranen med omvendt orientering, hvorved der dannes et unikt mellemprodukt. Efter translationen af de C-terminale positivt ladede tvillingelysinrester sker der en næsten global topologisk omlejringsproces.
Affinitetsoprensning viste, at ATP13A1 kan detektere det C-terminale positive ladningssignal af ABCG2. Udskiftning af lysinrester med negativt ladede eller neutrale aminosyrer dæmper interaktionerne mellem ATP13A1 og ABCG2 mutanter signifikant.
Desuden resulterede knockout af ATP13A1 i den tilsyneladende akkumulering af fejlfoldede ABCG2-konformationer, primært dem med forkert orienteret TMD6 i ER-membranen. Således spiller ATP13A1 en afgørende rolle i topogenesen af MSP'er, hvor dens ATPase-aktivitet fremmer dislokationen af det misorienterede TMD6 fra lipid-dobbeltlaget ind i cytosolen.
Efterfølgende genintegreres den cytosoliske TMD6 i ER-membranen, hvorved den post-translationelle topologiske omlejring af andre opstrøms TMD'er drives.
Efter vellykket omarrangering af TMD'er 4-6 kan mellemproduktet oligomerisere til en kvaternær struktur. Denne proces vil sandsynligvis lette integrationen af pTMD2 i den endelige struktur fra det vandige ER-lumen og ind i den modne struktur, som er tæt pakket ind af omgivende TMD'er.
Sammenfattende er undersøgelsen, nu offentliggjort i Molecular Cell , forklarer, hvordan en "vanskelig" pTMD co-translationelt springes over til indsættelse og post-translationelt begraves i den endelige korrekte struktur på det sene foldningsstadium, hvorved man undgår overdreven lipideksponering.
Navnlig på grund af eksponeringen af pTMD2 til ER-lumen under ABCG2-topogenesen, kan N441-glykosyleringsmodifikationen forårsaget af ABCG2-S441N-genmutationen signifikant blokere pTMD-samling på det sene stadium af topogenese. Da ABCG2 er en urinsyretransportør, forklarer denne undersøgelse, hvordan denne mutation er tæt forbundet med menneskelige sygdomme såsom gigt og hyperurikæmi.
Flere oplysninger: Jia Ji et al, En ATP13A1-assisteret topogenesevej til foldning af multi-spændende membranproteiner, Molecular Cell (2024). DOI:10.1016/j.molcel.2024.04.010
Journaloplysninger: Molekylær celle
Leveret af Chinese Academy of Sciences
Sidste artikelFodre indfødte økosystemer med affald
Næste artikelForskere bekræfter skalaforhold i bestemmelsen af ferskvandsfisks sårbarhed over for klimaændringer