1. Genekspression: Forskellige alleler kan føre til forskellige niveauer af genekspression, som igen kan påvirke et individs fænotype. For eksempel kan nogle individer have en højere ekspression af et gen, der koder for en vækstfaktor, hvilket kan føre til øget vækst.
2. Proteinfunktion: Forskellige alleler kan også føre til forskellige proteinfunktioner. For eksempel kan nogle individer have en mutation i et gen, der koder for et protein, der er involveret i stofskiftet, hvilket kan føre til ændringer i den måde, kroppen behandler fødevarer på.
3. Regulative elementer: Genetisk variation kan også påvirke aktiviteten af regulatoriske elementer, som er DNA-sekvenser, der styrer ekspressionen af gener. For eksempel kan nogle individer have en mutation i et regulatorisk element, der fører til overekspression af et gen, hvilket kan have en væsentlig indflydelse på individets fænotype.
4. Epigenetik: Epigenetik refererer til ændringer i genekspression, der ikke er forårsaget af ændringer i selve DNA-sekvensen. Disse ændringer kan være forårsaget af en række forskellige faktorer, såsom miljøfaktorer, og kan føre til individuelle forskelle inden for en art. For eksempel kan nogle individer have et højere niveau af DNA-methylering, hvilket kan føre til nedsat genekspression, mens andre kan have et lavere niveau af DNA-methylering, hvilket kan føre til øget genekspression.
5. Gen-miljø-interaktioner: Den genetiske baggrund for et individ kan også interagere med miljøet for at producere individuelle forskelle. For eksempel kan nogle individer være mere modtagelige for visse miljøgifte, mens andre kan være mere resistente.
Det komplekse samspil mellem genetisk variation, genekspression, proteinfunktion, regulatoriske elementer, epigenetik og gen-miljø-interaktioner giver anledning til det store udvalg af individuelle forskelle, som vi ser inden for en art.