Kvalitetskontrolforløb for nuklear protein:
1. Maskiner til import af nukleare proteiner: Det nukleare importmaskineri, som styrer bevægelsen af proteiner ind i kernen, har kvalitetskontrolmekanismer. Det kan skelne mellem korrekt foldede og forkert foldede proteiner, hvilket forhindrer indtrængen af forkert leverede proteiner i kernen.
2. Nuklear proteinfoldning og chaperoner: Molekylær chaperoner i kernen spiller en afgørende rolle i proteinfoldning og stabilisering. De hjælper med at genfolde fejlfoldede proteiner eller målrette dem til nedbrydning, hvis genfoldning mislykkes.
3. Nuklear proteasom: Kernen indeholder et specialiseret proteasomkompleks kendt som det nukleare proteasom. Det nedbryder fejlfoldede eller beskadigede proteiner i kernen, hvilket forhindrer deres ophobning.
4. Nuklear RNA-overvågningsveje: Nogle proteiner er oversat fra nukleare RNA-transkripter. Nukleare RNA-overvågningsmekanismer, såsom nonsens-medieret henfald (NMD), kan identificere og nedbryde forkert splejsede eller trunkerede transkripter, hvilket forhindrer dannelsen af fejlfoldede proteiner.
5. Ubiquitin-Proteasom System: Ubiquitin-proteasomsystemet (UPS) er en proteinnedbrydningsvej, der findes i hele cellen, inklusive kernen. Ubiquitin-ligaser kan mærke fejlleverede proteiner med ubiquitin-kæder og målrette dem til genkendelse og nedbrydning af proteasomet.
6. Autofagi: I ekstreme tilfælde, når store aggregater af fejlleverede proteiner dannes, kan cellen aktivere autofagi. Autofagi er en proces, hvor cellen opsluger og nedbryder dele af sit eget cytoplasma, herunder fejlfoldede proteiner, gennem specialiserede membranbundne rum kaldet autofagosomer.
7. Proteasom-uafhængig nedbrydning: Visse fejlleverede proteiner i kernen kan nedbrydes uafhængigt af proteasomet. Lysosomale veje eller andre proteolytiske mekanismer kan bidrage til clearance af disse proteiner.
Ved at anvende disse kvalitetskontrolveje kan cellen afbøde de skadelige virkninger af fejlleverede proteiner i kernen. Fejlfoldede eller beskadigede proteiner, der unddrager sig disse mekanismer, kan føre til akkumulering af toksiske proteinaggregater, hvilket bidrager til forskellige neurodegenerative sygdomme.