1. Sammenlignende embryologi:
Sammenligning af embryoner fra forskellige arter afslører slående ligheder i de tidlige udviklingsstadier. For eksempel går hvirveldyrs embryoner, inklusive mennesker, fisk, krybdyr og fugle, alle gennem et stadium med gællespalter og en hale, hvilket indikerer en fælles herkomst. Disse ligheder tyder på, at alle disse arter udviklede sig fra en fælles forfader med fiskelignende træk.
2. Udvikling af strukturer:
Embryonal udvikling viser, hvordan strukturer kan undergå ændringer og modifikationer under evolutionen. For eksempel har forbenene på mennesker, flagermus og hvaler forskellige funktioner, men begynder at udvikle sig på samme måde i embryonet. Efterhånden som udviklingen skrider frem, gennemgår de specialisering for at tjene specifikke funktioner i hver art, såsom hænder til at gribe i mennesker, vinger til at flyve i flagermus og svømmefødder til at svømme i hvaler.
3. Atavisme:
Lejlighedsvis kan individuelle organismer udvise atavistiske træk, som er forfædres egenskaber, der dukker op igen efter at have været fraværende i flere generationer. For eksempel kan mennesker sjældent have ekstra cifre på deres hænder eller fødder, hvilket er en tilbagevenden til vores evolutionære forfædre, som besad flere cifre.
4. Rekapitulationsteori:
Foreslået af Ernst Haeckel, foreslår denne teori, at en organismes embryonale udvikling går gennem stadier, der afspejler dens evolutionære historie. Med andre ord rekapitulerer embryoet kort de forfædres former, efterhånden som det udvikler sig. Det er dog vigtigt at bemærke, at dette koncept har begrænsninger og ikke fuldt ud repræsenterer den komplette evolutionære historie.
5. Fylogenetiske relationer:
Embryologiske egenskaber kan bruges til at udlede fylogenetiske forhold mellem organismer. Ved at analysere lighederne og forskellene i embryonal udvikling kan forskere konstruere evolutionære træer, der viser, hvordan forskellige arter er beslægtede og nedstammer fra fælles forfædre.
Studiet af embryonal udvikling, kendt som embryologi, har givet værdifuld indsigt i de evolutionære forhold mellem forskellige organismer og styrker beviserne, der understøtter evolutionsteorien.