Bakterier har ikke en kerne, fordi de er prokaryote organismer. Prokaryote organismer er karakteriseret ved deres mangel på en kerne og andre membranbundne organeller. I stedet har prokaryote celler et enkelt, cirkulært kromosom, der er placeret i cytoplasmaet. Dette kromosom er ikke omsluttet af en kernemembran, men er i stedet knyttet til cellemembranen.
Prokaryote celler mangler også andre membranbundne organeller, såsom mitokondrier, kloroplaster og endoplasmatisk retikulum. Det betyder, at prokaryote celler skal udføre alle deres cellulære funktioner i cytoplasmaet.