Proteiner indeholder på den anden side aminosyrer. Der er 20 forskellige typer aminosyrer, der kan findes i proteiner. Disse aminosyrer er bundet sammen i en bestemt rækkefølge for at danne polypeptider. Polypeptider er byggestenene i proteiner.
Rækkefølgen af aminosyrer i et protein bestemmer dets struktur og funktion. Proteiner spiller en afgørende rolle i mange cellulære processer, herunder metabolisme, vækst og reproduktion.