Fosforyleringen af ADP involverer tre specifikke underenheder inden for CF1-domænet:
α underenhed: Denne underenhed indeholder det aktive sted for ATP-syntese og hydrolyse. Det binder ADP og uorganisk fosfat (Pi) og letter den kemiske reaktion, der omdanner ADP til ATP.
β-underenhed: β-underenheden hjælper med bindingen af ADP og Pi til det katalytiske sted på α-underenheden. Det deltager også i de konformationelle ændringer, der opstår under ATP-syntese og hydrolyse.
γ underenhed: γ-underenheden spiller en afgørende rolle i energitransduktion. Den forbinder den roterende c-underenhed i det transmembrane domæne (CF0) med de katalytiske α- og β-underenheder i CF1 domænet. Rotationen af y-underenheden på grund af protongradienten over thylakoidmembranen driver de konformationelle ændringer, der fører til ADP-phosphorylering.
Disse tre underenheder arbejder sammen med andre komponenter i CF1-domænet for at lette phosphoryleringen af ADP og syntesen af ATP i chloroplast-ATP-syntasen.