Den primære struktur af et protein dannes af lineær sekvens af aminosyrer der er knyttet sammen af peptidbindinger .
Tænk på det som en kæde, hvor hvert link er en aminosyre. Rækkefølgen af disse aminosyrer er afgørende, da det bestemmer proteinets unikke tredimensionelle struktur og i sidste ende dets funktion.