1. Fossilrekord: Fossiler giver en direkte oversigt over liv på jorden over millioner af år. Vi ser klare ændringsmønstre i organismer over tid, hvor enklere livsformer vises tidligere i den geologiske rekord og mere komplekse former dukker op senere. F.eks. Viser fossilrekorden overgangen fra fisk til amfibier, krybdyr til pattedyr og udviklingen af heste fra små, multi-toed forfædre til de store, enkelt-toed dyr, vi kender i dag. Denne progression af fossiler giver overbevisende bevis for, at livet har ændret sig over tid, hvilket understøtter ideen om evolution.
2. homologe strukturer: Dette er strukturer, der findes i forskellige arter, der deler en fælles underliggende anatomi, på trods af at have forskellige funktioner. Et klassisk eksempel er knoglestrukturen i svirveldyrets forben:mennesker, katte, flagermus og hvaler deler alle et lignende knoglearrangement i deres forelimbs, selvom disse lemmer bruges til meget forskellige aktiviteter (griber, går, flyver, svømmer). Denne lighed peger på en fælles stamfar, hvilket indikerer, at disse arter stammede fra en delt afstamning. Tilstedeværelsen af homologe strukturer understøtter stærkt ideen om fælles afstamning og evolutionær ændring.