Mens DNA er dobbeltstrenget, er RNA enkeltstrenget. Dette betyder, at det kun har en kæde af nukleotider, der er knyttet sammen.
Det er dog vigtigt at bemærke, at RNA undertiden kan foldes tilbage på sig selv og danne komplekse tredimensionelle strukturer. Denne foldning skyldes parring af komplementære baser inden for den enkelte streng, svarende til hvordan DNA -strenge par.