* byggesten: Både peptider og proteiner består af aminosyrer, der er forbundet med peptidbindinger.
* struktur: De har begge primære, sekundære, tertiære og undertiden kvartære strukturer. Disse strukturer bestemmer deres form og funktion.
* Biologisk aktivitet: Begge kan have en bred vifte af biologiske aktiviteter, herunder at fungere som enzymer, hormoner, antistoffer og strukturelle komponenter i celler.
Her er en sammenbrud af deres vigtigste forskelle:
| Funktion | Peptider | Proteiner |
| ---------------- | --------------------------------------- | ------------------------------------ |
| Størrelse | Korte kæder (2-50 aminosyrer) | Lange kæder (> 50 aminosyrer) |
| Kompleksitet | Enkel struktur | Kompleks struktur |
| Funktion | Fungerer normalt som hormoner eller signalmolekyler | Har en bredere vifte af funktioner |
| Eksempler | Insulin, oxytocin, glucagon | Hemoglobin, kollagen, antistoffer |
I det væsentlige:
* Peptider er som mindre byggesten, der kan samles i større strukturer.
* Proteiner er de større strukturer, der er bygget af disse blokke, med mere komplekse funktioner.
Det er vigtigt at bemærke, at linjen mellem et peptid og et protein ikke altid er klar. Der er ingen universelt aftalt størrelsesforskel mellem dem, og nogle peptider er meget store og har komplekse funktioner.