* mitokondrier: Disse organeller, der er ansvarlige for cellulær respiration, har deres eget DNA kaldet mitokondrisk DNA (mtDNA) . MtDNA er cirkulær og koder for proteiner involveret i mitokondrial funktion.
* chloroplaster: I planteceller har chloroplaster, der er ansvarlige for fotosyntesen, også deres eget DNA kaldet chloroplast -DNA (cpDNA) . CPDNA er også cirkulær og koder for proteiner involveret i fotosyntesen.
Det er vigtigt at huske, at disse organeller antages at have stammet fra fritlevende bakterier, der blev indhyllet af eukaryote celler for milliarder for år siden. De bevarer stadig deres eget DNA, som er adskilt fra det nukleare DNA.