Hvad er de forskellige typer RNA -polymeraser og deres promotorer?

Typer af RNA -polymeraser og deres promotorer

RNA -polymeraser er enzymer, der er ansvarlige for transkription af DNA til RNA. Forskellige typer RNA -polymeraser findes i eukaryoter og prokaryoter, hver med dets specifikke funktioner og promotorsgenkendelsessekvenser.

prokaryoter:

* RNA -polymerase (RNAP) :Den enkelte RNA -polymerase i prokaryoter transkriberer alle typer RNA (mRNA, tRNA, rRNA).

* promotorstruktur:

* -10 element (Pribnow Box): Tataat -sekvens placeret ca. 10 basepar opstrøms fra transkriptionsstartstedet.

* -35 Element: TTGACA -sekvens placeret omkring 35 basepar opstrøms fra transkriptionsstartstedet.

* opstrøms elementer: Nogle promotorer har yderligere elementer længere opstrøms, hvilket påvirker transkriptionseffektivitet.

eukaryoter:

* RNA -polymerase I (Pol I): Ansvarlig for transkriberende ribosomale RNA (rRNA) gener.

* promotorstruktur:

* kernepromotor: En region, der indeholder et kerneelement og et opstrøms kontrolelement (UCE).

* kerneelement: En kort sekvens placeret ca. 40 bp opstrøms for transkriptionsstartstedet.

* uce: En region placeret ca. 100 bp opstrøms for transkriptionsstartstedet, der ofte indeholder en konserveret sekvens kaldet "opstrøms element" (UE).

* RNA -polymerase II (pol II): Transkriberer proteinkodende gener (mRNA) og nogle små nukleare RNA (SNRNA) gener.

* promotorstruktur:

* kernepromotor: Indeholder typisk følgende elementer:

* tata boks: En konserveret sekvens placeret ca. 25-30 bp opstrøms for transkriptionsstartstedet.

* initiator (INR): En sekvens placeret omkring transkriptionsstartstedet.

* nedstrøms promotorelement (DPE): Beliggende nedstrøms for transkriptionsstartstedet.

* BRE (TFIIB -genkendelseselement): En sekvens placeret opstrøms for Tata -boksen, genkendt af transkriptionsfaktor IIB (TFIIB).

* opstrøms regulatoriske elementer: Disse elementer kan være placeret hundreder eller endda tusinder af basepar opstrøms for kernepromotoren og påvirke transkriptionens hastighed. Eksempler inkluderer:

* CAAT -boks: En konsensus -sekvens, der binder transkriptionsfaktorer.

* GC Box: En GC-rig sekvens genkendt af transkriptionsfaktorer.

* Enhancers: DNA -sekvenser, der kan stimulere transkription, ofte placeret langt fra kernepromotoren.

* RNA -polymerase III (Pol III): Transkriberer overførsel RNA (tRNA), 5S ribosomalt RNA (5S rRNA) og nogle små nukleare RNA (SNRNA) gener.

* promotorstruktur:

* intern promotor: Placeret inden for det transkriberede område for tRNA og 5s rRNA -gener.

* opstrøms promotor: Beliggende opstrøms for den transkriberede region for nogle snRNA -gener.

Sammendragstabel:

| RNA -polymerase | Udskrifter | Promotorer |

| --- | --- | --- |

| Prokaryotisk RNAP | mRNA, tRNA, rRNA | -10 element, -35 element, opstrøms elementer |

| Eukaryotisk pol I | rRNA | Core Promoter, Uce |

| Eukaryotisk pol II | mRNA, nogle snRNA | Core Promoter (Tata Box, INR, DPE, BRE), opstrøms regulatoriske elementer |

| Eukaryotisk pol III | tRNA, 5S rRNA, nogle snRNA | Intern promotor (for tRNA, 5s rRNA), opstrøms promotor (for noget snRNA) |

Denne tabel er ikke udtømmende, da forskellige typer promotorer og deres regulatoriske elementer findes i hver gruppe. De specifikke sekvenser og strukturer af promotorer kan variere, hvilket påvirker effektiviteten og reguleringen af transkription.