Tumorkode, en software til at simulere vaskulariserede tumorer

Tumorvaskulaturen er et vigtigt mål for kræftbehandlinger. Rieger, Fredrich og Welter ved Saarland University, Tyskland har forfulgt en kvantitativ analyse af de fysiske determinanter for vaskulariserede tumorer i flere år. Ved hjælp af computersimuleringer har de været i stand til at rekapitulere den viden, der er opnået fra in vitro -forskning af tumorsfæroider, dyremodeller og kliniske undersøgelser og har genskabt et vaskulariseret tumorsystem i silico.

De har for nylig frigivet tumorkode, en software, der samler flere kendte modeller i en multi-skala tilgang, der gør det muligt at beskrive tumorvækst i længdeskalaer, der er relevante for kliniske anvendelser. Koden og en detaljeret brugermanual er åbne og offentligt tilgængelige, i håb om, at yderligere brug og forbedringer vil fremskynde fremskridt og opdagelse i feltet.

Heri EPJE Tips og tricks papir forfatterne præsenterer de tekniske aspekter efter arbejdsgangen i en typisk simuleringsprocedure. Det er vigtigt, at deres tilgang tillader undersøgelse af topologiske og funktionelle aspekter på samme tid, som er relevant for terapeutiske behandlinger.

Tumorkodens kildekode er tilgængelig under open source-licens på:https://github.com/thierry3000/tumorcode