Makassar-strædet, der ligger mellem Kalimantan (Indonesisk Borneo) og Sulawesi, spiller en afgørende rolle i den indonesiske gennemstrømning (ITF) og regional oceanografi. Det forbinder Stillehavet og Det Indiske Ocean og påvirker i høj grad vandudvekslingen mellem de to bassiner. Mens ITF er anerkendt som en primær drivkraft bag Makassar-strædets dynamik, bidrager saltholdighedsvariation også til dens sæsonbestemte variation. Her analyserer vi virkningerne af saltholdighed på den sæsonmæssige variation af Makassar-strædets gennemstrømning ved hjælp af 25 års havreanalysedata og in situ observationer. Vores resultater viser, at tilstrømningstransporten i Makassar-strædet er negativt korreleret med saltholdigheden i havet, hvilket tyder på et omvendt forhold mellem saltholdighed og transportstyrke. Desuden påvirker saltholdighedsændringer ITF's vej gennem Makassar-strædet, hvilket påvirker overfladecirkulationen i sundet. Desuden foreslår vi, at saltholdighedseffekter kan spille en afgørende rolle i interårlig-til-årti-variabilitet af Makassar-strædets gennemstrømning, men yderligere undersøgelse er nødvendig for at verificere disse forbindelser.