Sådan fungerer det:
* marine organismer: Mange marine organismer, som koraller, bløddyr, foraminifera og alger, bruger calciumcarbonat (CACO3) til at bygge deres skeletter og skaller. Dette calciumcarbonat er primært i form af kalsit.
* død og forfald: Når disse organismer dør, sætter deres hårde dele sig til havbunden.
* Akkumulering: Over tid danner ophobningen af disse skelet- og skalfragmenter et tykt lag sediment.
* litificering: Dette sediment gennemgår en proces kaldet litificering, hvor den komprimeres og cementeres sammen af mineraler, primært kalsit.
* Kalkstensdannelse: Den resulterende klippe er kendt som kalksten, primært sammensat af kalsit, der stammer fra de organiske rester.
Derfor er organisk dannet kalksten i det væsentlige en samling af det gamle havliv, hvor kalsit er den vigtigste mineralkomponent, der er hentet fra deres hårde dele.