Proteiner daterer sig tilbage til sabeltandets tid

Planteforskere ved University of Western Australia har opdaget en helt ny familie af små proteiner kaldet PLP'er (PawL Peptides), der dannes ved at piggybacke på andre proteiner.

Forskerne fandt ud af, at 'protein-piggybacking' af PLP'er begyndte i frø af en tusindfryd-forfader, der eksisterede for 45 millioner år siden i den eocæne epoke-periode - omkring det tidspunkt, hvor sabeltandkatte gik på jorden.

Undersøgelsen omfattede forskere fra University of Western Australia, La Trobe University i Melbourne og University of California San Diego i USA og er blevet publiceret i open access-tidsskriftet Plant Direct.

Holdet har tidligere vist, at proteiner som disse udviklede sig inde i en ikke-relateret proteinvært, men hvor stor denne familie var, overraskede dem.

Brug af instrumenter, der er i stand til at adskille proteiner, før de vejes med ekstrem præcision, holdet adskilte og sekventerede næsten 50 bittesmå PLP'er. Strukturerne for nogle blev analyseret ved hjælp af maskiner med stærke magnetfelter, der blev brugt til at justere atomerne. De fleste PLP'er bestod kun af syv eller otte aminosyreblokke.

Arbejdet vil hjælpe videnskabsmænd med at forstå proteiners adfærd og kan anvendes i terapeutisk lægemiddelbehandling eller endda til brug i nanorør-enheder.

Hovedforfatter Mark Fisher, Ph.D. studerende ved UWA's School of Molecular Sciences sagde, at forskningen bekræftede, at PLP'er har eksisteret siden oldtiden og udviklet sig til en enorm og forskelligartet klasse, der findes blandt medlemmer af tusindfrydfamilien.

"Superstabile peptider som disse PLP'er menes at repræsentere den næste generation af lægemidler, og vi har lige fundet dusinvis af dem, og de er ulig noget tidligere set, " sagde hr. Fisher.

"I lang tid, proteiner, denne lillebitte blev antaget at være samlet som LEGO, en aminosyreblok ad gangen. Vi har vist, at de er skåret ud af meget større proteiner kodet af gener.

"Deres overflod og den måde, så mange sekvenser er begravet inde i et værtsprotein, får os til at spekulere på, om andre værdifulde molekyler på samme måde gemmer sig i proteiner fra andre organismer, venter bare på at blive opdaget."

UWA Laboratory Head Dr. Joshua Mylne sagde, at arbejdet havde afsløret en proteinfamilie, der er større end mange andre kan lide den.

"I årevis havde vi uforvarende smidt disse bittesmå proteiner i skraldet sammen med alle fedtstofferne og olierne, da vi rensede proteinerne ud af frøekstrakter. De er så små, de opfører sig næsten ikke som proteiner overhovedet.

"Nu har vi så mange af dem i vores hænder, det er tid til at finde ud af, hvorfor planter laver så mange forskellige i deres frø. Disse proteiner findes kun i tusindfryds frø, og det er svært at vide, hvad de laver, da de varierer så meget i deres egenskaber."

Dr. Mylne ledede holdet af australske og amerikanske videnskabsmænd, der afslørede denne nye familie af proteiner gennem det australske forskningsråd-støttede studie "En familie af små, cykliske peptider begravet i preproalbumin siden den eocæne epoke."