Forskere samler et bibliotek af sukkerarter

Sukkerstrukturer kaldet GAG'er er til stede i næsten alle væv i den menneskelige krop, og har vigtige funktioner i forskellige sygdomme. Forståelsen af ​​disse sukkerstrukturer er begrænset, fordi redskaber til at studere dem har manglet. Nu, forskere fra Københavns Universitet har samlet et sådant værktøj - et cellulært bibliotek af sukkerarter.

De fleste af os har en tendens til at tænke på sukker som en ernæringsmæssig fare. Imidlertid, sukker er en væsentlig bestanddel af den menneskelige krop; det dækker overfladerne af vores celler og proteiner, og tuner vores vævs adfærd og funktion i både sundhed og sygdom.

Glycosaminoglycaner (GAG'er) omfatter en gruppe sukkerarter, der findes i næsten alle væv i den menneskelige krop. Nogle af disse sukkerarter bliver allerede brugt som blodfortyndende medicin eller som et middel til at forhindre betændelse. Imidlertid, en generel forståelse af, hvad disse sukkerarter gør, mangler stadig. Dette skyldes blandt andet, at forskere ikke har haft effektive værktøjer til at undersøge sukkerarter en struktur ad gangen.

Nu, forskere fra Copenhagen Center for Glycomics ved Københavns Universitet har med succes kortlagt sukkerstrukturerne i et såkaldt 'bibliotek af sukker' i en ny undersøgelse offentliggjort i Naturens metoder . Biblioteket – som har fået navnet GAGOme – består af gensplejsede celler, som viser definerede variationer af GAG-struktur.

"Vi ved, at disse strukturer er vigtige, men vi er kun lige begyndt at forstå, hvor vigtige de er og på hvilke måder. Så forhåbentlig, vores nye værktøj vil gøre os i stand til at få ny viden og måder at anvende den på i forskellige sygdomme, " siger forfatter Yen-Hsi Chen, postdoc ved Copenhagen Center of Glycomics.

Forskerne brugte værktøjet CRISPR/Cas9 - almindeligvis kendt som "genetisk saks" - til at fjerne eller introducere specifikke enzymer involveret i GAG-syntese. Dette gjorde dem i stand til at generere et stort panel af celler med et næsten komplet repertoire af GAG-modifikationer.

GAGOme vil give forskere mulighed for at teste den biologiske funktion af et specifikt sulfateringsmønster eller en defineret længde og sammensætning af sukkerkæden. Forskerne forestiller sig også, at biblioteket kan anvendes til syntetisering af proteiner dekoreret med definerede GAG ​​-kæder, og potentielt stoffer.