Formålet med bufferen i elektroforese

Biokemikere og molekylærbiologer bruger elektroforese til at adskille makromolekyler som proteiner og nukleinsyrer. Dette giver forskere mulighed for at isolere og analysere individuelle proteiner eller nukleinsyresekvenser i en kompleks blanding. Et typisk eksempel på elektroforese i laboratoriet er en mikrobiolog, der bruger Polymerase Chain Reaction (PCR) til at adskille DNA-fragmenter produceret i et mikrobielt samfund. Uanset formålet kræver elektroforese altid brugen af en bufferopløsning.

TL; DR (for lang; læste ikke)

Elektroforese adskiller makromolekyler som protein og nukleinsyrer efter størrelse, gebyr og andre egenskaber. Ved elektroforese, der adskilles ved ladning, bruger forskere buffer til at overføre denne ladning gennem gelen. Buffer opretholder også gelen ved en stabil pH-værdi, hvilket minimerer ændringer, der kan forekomme i proteinet eller nukleinsyren, hvis de udsættes for ustabil pH.
Principper for elektroforese

Elektroforese adskiller molekyler langs en gradient baseret på deres størrelse, "charge or other properties.", 3, [[Denne gradient kan være et elektrisk felt eller, i tilfælde af Denaturerende gradientgelelektroforese (DGGE), et denatureringsmiddel, såsom en blanding af urinstof og formamid. Proteiner migrerer mod anoden, hvis den er negativt ladet, og katoden, hvis den er positivt ladet. Da større molekyler vandrer langsommere end mindre molekyler, kan forskere måle den tilbagelagte afstand og bruge logaritmer til at bestemme størrelsen af fragmenterne.
Denaturing Gradient Gel Electrophoresis

Med DGGE bevæger DNA sig langs en gradient af stigende denaturerende magt, indtil kraften er tilstrækkelig til at denaturere eller udfolde det særlige DNA-fragment fuldstændigt. På dette tidspunkt stopper migreringen. Forskere kan bruge denne metode til at adskille fragmenter baseret på deres individuelle følsomhed for denaturering.
Hvad bufferen gør