Beregningsundersøgelse afslører, hvordan ebola-nukleocapsid stabiliserer sig

Ebola-virussen er et dødeligt patogen, der forårsager hæmoragisk feber hos mennesker og ikke-menneskelige primater. Virusset er sammensat af et enkeltstrenget RNA-genom, der er indkapslet af et nukleokapsidprotein (NP). NP er ansvarlig for at beskytte det virale RNA mod nedbrydning og for at lette dets replikation og transkription.

Tidligere undersøgelser har vist, at NP af Ebola-virussen er et meget dynamisk protein, der gennemgår en række konformationelle ændringer i løbet af sin livscyklus. Imidlertid er de molekylære mekanismer, der ligger til grund for disse konformationelle ændringer, ikke fuldt ud forstået.

I en nylig undersøgelse brugte forskere fra University of Texas i Austin beregningsmetoder til at undersøge den strukturelle dynamik af ebolavirus NP. Deres resultater afslører, at NP er stabiliseret af et netværk af hydrogenbindinger og saltbroer mellem dets forskellige domæner. Dette netværk af interaktioner hjælper med at opretholde NP i dets funktionelle konformation og forhindrer det i at udfolde sig.

Forskerne fandt også, at NP er modtagelig for proteolytisk spaltning af værtsproteasen furin. Furinspaltning af NP udløser en række konformationelle ændringer i proteinet, der fører til frigivelsen af ​​det virale RNA fra nukleokapsiden.

Disse resultater giver ny indsigt i de molekylære mekanismer, der regulerer den konformationelle dynamik af Ebola-virus NP. Denne information kan bruges til at udvikle nye terapeutiske strategier til at målrette mod NP og forhindre replikation af virussen.

Undersøgelsen blev offentliggjort i tidsskriftet "The Journal of Physical Chemistry B".