Når atomer i et molekyle ikke deler deres elektroner ligeligt, dannes en polær kovalent binding. I en polær kovalent binding trækkes elektronerne stærkere mod det ene atom end det andet. Dette skaber en delvis positiv ladning på atomet, der taber elektroner, og en delvis negativ ladning på atomet, der får elektroner. Polariteten af en kovalent binding bestemmes af forskellen i elektronegativitet mellem de to atomer. Elektronegativitet er et mål for et atoms evne til at tiltrække elektroner. Jo større forskellen er i elektronegativitet mellem to atomer, jo mere polær vil den kovalente binding være.