For at bestemme den elektroniske geometri af et molekyle skal vi overveje antallet af elektronpar omkring det centrale atom. I tilfælde af sulfit er svovlatomet det centrale atom. Det har tre iltatomer bundet til sig og et ensomt elektronpar. Dette giver i alt fire elektronpar omkring svovlatomet.
Ifølge VSEPR-teorien vedtager fire elektronpar omkring et centralt atom et tetraedrisk arrangement. Men i tilfælde af sulfit er et af elektronparrene et ensomt par. Ensomme par fylder mere end bindende par, så de forårsager, at det tetraedriske arrangement forvrænges. Dette resulterer i en trigonal pyramideformet elektronisk geometri.
Sulfits molekylære geometri er også trigonal pyramideformet. Det skyldes, at den molekylære geometri er bestemt af atomernes arrangement, og atomerne er arrangeret i en trigonal pyramideform for at minimere frastødningen mellem elektronparrene.