* pyrophosphat (PPI): Dette er et molekyle, der består af to fosfatgrupper, der er knyttet sammen. Det frigøres under dannelsen af phosphodiesterbindingen mellem fosfatgruppen af et nukleotid og sukkerets sukker.
* vand (H₂O): Dette frigøres under kondensationsreaktionen, der forbinder nukleotidbasen til sukkermolekylet.
Her er en sammenbrud af processen:
1. Aktivering: En nukleosidtriphosphat (NTP) som ATP, GTP, CTP eller TTP aktiveres. Dette involverer brud på en højenergi-binding inden for NTP, der frigiver pyrophosphat (PPI).
2. tilknytning: Det aktiverede nukleotid, nu et nukleosidmonophosphat (NMP), er fastgjort til 3 'hydroxylgruppen af en voksende polynukleotidkæde. Dette involverer en kondensationsreaktion, der frigiver vand (H₂O).
Kortfattet:
* nukleotidsyntese involverer dannelsen af en phosphodiester -binding og en kondensationsreaktion, frigivelse pyrophosphat (PPI) og vand (H₂O) henholdsvis.
Vigtig note: Pyrophosphat (PPI) opdeles yderligere i to uorganiske phosphatmolekyler (PI) af et enzym kaldet pyrophosphatase. Denne reaktion er meget gunstig og driver nukleotidsynteseaktionen fremad.