Videnskab
 Science >> Videnskab >  >> Kemi

Har AT-rige eller GC-rige DNA højere smeltetemperatur?

GC-rige DNA har en højere smeltetemperatur (TM) end AT-RICH DNA.

Her er hvorfor:

* Hydrogenbinding: Guanin (G) og cytosin (C) danner tre hydrogenbindinger med hinanden, mens adenin (A) og thymin (T) kun danner to brintbindinger.

* Stabling af interaktioner: De plane baser i DNA -stak ovenpå hinanden. GC -par har mere effektive stablingsinteraktioner på grund af deres større overfladeareal og stærkere hydrofobe interaktioner.

* stabilitet: Den stærkere hydrogenbinding og mere gunstige stablingsinteraktioner i GC -par bidrager til en højere samlet stabilitet af DNA -molekylet.

Derfor fører et højere GC -indhold til en højere smeltetemperatur.

Praktiske implikationer:

* PCR: I polymerasekædereaktion (PCR) foretrækkes primere med højere GC -indhold ofte, fordi de har en højere TM, hvilket kan forbedre reaktionens specificitet og effektivitet.

* DNA -hybridisering: Højere GC -indhold i prober, der bruges til DNA -hybridisering, kan øge deres bindingsaffinitet og specificitet.

* genomik: Regioner af genomet med højt GC-indhold er ofte forbundet med genrige regioner og har et højere niveau af transkriptionel aktivitet.

Sammenfattende er GC-rige DNA mere stabilt end AT-rigt DNA og har derfor en højere smeltetemperatur.

Varme artikler